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Path3CT [ SAMPLE ]

Species Name
Initial Concentration
jfix (constant, trapezoidal, rectangle)
npulse
Sequence
 
Glucose
G6P
HK
F6P
PGI
FBP
PFK
Aldolase
DHAP
GAP
TPI
GAPDH
BPG
PGK
3PG
2PG
PGM
PEP
Enolase
PK
Pyruvate
Pyruvate DH
Acetyl CoA
Citrate Synthase
OAA
Citrate
Aconitase
Isocitrate
AKetoglutarate
Isocitrate DH
Succinyl CoA
AKetoglutarate DH
Succinate
Succinyl CoA Synthetase
Succinic DH
Fumarate
Malate
Fumarase
Malate DH
Lactate
Lactate DH
Pyruvate Decarboxylase
Acetaldehyde
Ethanol
Alcohol DH

Reactions
forward
backward
Glucose + HK <--> G6P + HK
G6P + PGI <--> F6P + PGI
F6P + PFK <--> FBP + PFK
FBP + Aldolase <--> Aldolase + DHAP + GAP
DHAP + TPI <--> GAP + TPI
GAP + GAPDH <--> BPG + GAPDH
BPG + PGK <--> 3PG + PGK
3PG + PGM <--> PGM + 2PG
2PG + Enolase <--> PEP + Enolase
PK + PEP <--> PK + Pyruvate
Pyruvate + Pyruvate DH <--> Pyruvate DH + Acetyl CoA
Acetyl CoA + Citrate Synthase + OAA <--> Citrate Synthase + Citrate
Citrate + Aconitase <--> Isocitrate + Aconitase
Isocitrate + Isocitrate DH <--> AKetoglutarate + Isocitrate DH
AKetoglutarate + AKetoglutarate DH <--> Succinyl CoA + AKetoglutarate DH
Succinyl CoA + Succinyl CoA Synthetase <--> Succinyl CoA Synthetase + Succinate
Succinate + Succinic DH <--> Fumarate + Succinic DH
Fumarate + Fumarase <--> Fumarase + Malate
Malate + Malate DH <--> Malate DH + OAA
Pyruvate + Lactate DH <--> Lactate DH + Lactate
Pyruvate Decarboxylase + Pyruvate <--> Pyruvate Decarboxylase + Acetaldehyde
Acetaldehyde + Alcohol DH <--> Alcohol DH + Ethanol

Inital
Time
Final
Time
Number of
Time Steps
Skip
Integration
Option


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