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quorum_2_Alex [ SAMPLE ]
Species Name
Initial Concentration
jfix (constant, trapezoidal, rectangle)
npulse
Sequence
lacI^0
lacI^1
lacI^r
lacI^P
tetR^0
tetR^1
tetR^r
tetR^P
cI^0
cI^1
cI^r
cI^P
luxI^0
luxI^1
luxI^r
luxI^P
AI1
AI2
AI^E
lacI^0_2
lacI^1_2
lacI^r_2
lacI^P_2
tetR^0_2
tetR^1_2
tetR^r_2
tetR^P_2
cI^0_2
cI^1_2
cI^r_2
cI^P_2
luxI^0_2
luxI^1_2
luxI^r_2
luxI^P_2
Reactions
forward
backward
lacI^1 + cI^P + AI1 <--> lacI^0
lacI^0 <--> lacI^1
lacI^P + tetR^1 <--> tetR^0
tetR^0 <--> tetR^1
tetR^P + cI^1 <--> cI^0
cI^0 <--> cI^1
lacI^1 <--> lacI^1 + lacI^r
tetR^1 <--> tetR^1 + tetR^r
cI^1 <--> cI^1 + cI^r
lacI^r <--> lacI^r + lacI^P
tetR^r <--> tetR^P + tetR^r
cI^r <--> cI^r + cI^P
lacI^r <-->
lacI^P <-->
tetR^r <-->
tetR^P <-->
cI^r <-->
cI^P <-->
luxI^1 + lacI^P <--> luxI^0
luxI^0 <--> luxI^1
luxI^1 <--> luxI^1 + luxI^r
luxI^r <--> luxI^r + luxI^P
luxI^r <-->
luxI^P <-->
lacI^0_2 <--> lacI^1_2
tetR^1_2 + lacI^P_2 <--> tetR^0_2
tetR^0_2 <--> tetR^1_2
cI^1_2 <--> cI^0_2
cI^0_2 <--> cI^1_2
luxI^0_2 <--> luxI^1_2
lacI^1_2 <--> lacI^1_2 + lacI^r_2
tetR^1_2 <--> tetR^1_2 + tetR^r_2
cI^1_2 <--> cI^1_2 + cI^r_2
lacI^r_2 <--> lacI^r_2 + lacI^P_2
tetR^r_2 <--> tetR^r_2 + tetR^P_2
cI^r_2 <--> cI^r_2 + cI^P_2
luxI^r_2 <--> luxI^r_2 + luxI^P_2
luxI^P <--> luxI^P + AI1
luxI^P_2 <--> AI2 + luxI^P_2
lacI^1_2 + cI^P_2 + AI2 <--> lacI^0_2
lacI^r_2 <-->
lacI^P_2 <-->
tetR^r_2 <-->
tetR^P_2 <-->
cI^r_2 <-->
AI1 <--> AI^E + AI1
AI2 <--> AI^E + AI2
cI^P_2 <-->
luxI^r_2 <-->
luxI^P_2 <-->
luxI^1_2 <--> luxI^1_2 + luxI^r_2
luxI^1_2 + lacI^P_2 <--> luxI^0_2
Inital
Time
Final
Time
Number of
Time Steps
Skip
Integration
Option
Euler
Euler Modified
Fourth Order Runge-Kutta
Adaptive Runge-Kutta
BDF order 2
LSODES
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