Plots For 'Erin Repressilator'

Erin Repressilator [ SAMPLE ]

Species Name	Initial Concentration	jfix (constant, trapezoidal, rectangle)	npulse	Sequence
A0
Ar
Ap
B0
B1
Br
Bp
C0
C1
Cr
Cp
A1
RA/Ap
RA

Reactions forward backward

A1 + Cp + Cp <--> A0 + Cp + Cp

A0 <--> A1

Ar <--> Ar + Ap

A1 <--> Ar

Ar <-->

Ap + B1 + Ap <--> B0 + Ap + Ap

B0 <--> B1

B1 <--> Br

Br <-->

Ap <-->

Br <--> Br + Bp

Bp <-->

Bp + C1 + Bp <--> C0 + Bp + Bp

C0 <--> C1

C1 <--> Cr

Cr <--> Cp + Cr

Cp <-->

Cr <-->

RA + Ap <--> RA/Ap

RA/Ap <-->

Inital
Time Final
Time Number of
Time Steps Skip Integration
Option

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Reactions	forward	backward
A1 + Cp + Cp <--> A0 + Cp + Cp
A0 <--> A1
Ar <--> Ar + Ap
A1 <--> Ar
Ar <-->
Ap + B1 + Ap <--> B0 + Ap + Ap
B0 <--> B1
B1 <--> Br
Br <-->
Ap <-->
Br <--> Br + Bp
Bp <-->
Bp + C1 + Bp <--> C0 + Bp + Bp
C0 <--> C1
C1 <--> Cr
Cr <--> Cp + Cr
Cp <-->
Cr <-->
RA + Ap <--> RA/Ap
RA/Ap <-->

Inital Time	Final Time	Number of Time Steps	Skip	Integration Option